“Lycoris” é o nome dos agentes de uma organização secreta que mantém a paz no Japão, a “Ataque Direto”. Takina, uma dessas agentes, acaba sendo transferida de setor por desobedecer ordens superiores. Ela vai para o “LycoReco”, um café afiliado à organização, onde encontra a agente de elite Chisato Nishikigi. Que definitivamente não é o que Takina esperava.